El primer campeón de la Liga de Football Departamental de Artigas fue el Novo Quarahy F.C. que logró el título en sus cuatro primeras ediciones.
Es una señal evidente de que los ingleses que integraban sus planteles en aquellos comienzos, aún llevaban cierta ventaja a la hora de competir, algo que supieron transmitir a sus compañeros de equipo.
Pero en poco tiempo los criollos se foguearon, adquirieron experiencia y aportaron lo suyo para enfrentarlos en igualdad de condiciones primero, y luego superarlos.
Los campeonatos ganados por San Eugenio F. C. en la Liga de Fútbol de Artigas comienzan en 1918 con su primer octenio - ocho veces seguidas - que llega hasta el año 1925.
Luego siguen los triunfos en los siguientes años:
1928-29 / 1933-34-35-36 / 1943 / 1950-52-54-56-57-58 / 1960-62-64-67-69 / 1972-73 / 1984-85-86-89 / 1993-94-95-96-97-98-99 / 2000-05-07
Al 8 de mayo de 2008 día en que conmemoró sus primeros Cien años - siendo el actual Campeón - San Eugenio logró ganar hasta entonces 42 campeonatos locales.
En 1970 ganó el Campeonato de Clubes Campeones del Interior Copa EL PAIS.
En 1993 - cuando cumplió 75 años - San Eugenio comenzó su segunda serie de ocho campeonatos seguidos que completó en el 2000.
Fue el mayor ganador del siglo XX y comenzó ganando en el siglo XXI.
En esa época compitió contra equipos profesionales de la capital por un lugar en la Liguilla Pre-Liberadores de América, caso único en el departamento.
Además en competiciones interdepartamentales fue 5 veces Campeón del litoral y 4 veces Vice - Campeón del Interior.
Es el único equipo local que solamente ha actuado en la Divisional A
Nombres de algunas copas y trofeos ganados por San Eugenio:
Trofeo Ariel - Trofeo Olavo Bilac - Copa Hector Miranda - Medallas del Consejo Dptal. De Administración - Copa Tribuna Salteña - Copa Ibarlucea - Copa Ministerio de Instrucción Pública - Copa Vega Helguera y Cía - Copa José D'Amado - Copa Quiró Saldaña - Copa "50 años de San Eugenio" - Copa El País - Copa Luis Alberto "Chichito" Fernández - Copa Robert William Alves - Copa 70 años del Club Wanderers
PRESIDENTES DE SAN EUGENIO 1908 - 2008
Pablo B. Tognola --- 1909 - 10 - 11
Juan A. Calvo --- 1912
Candido Morisio --- 1913
José M. Etcheverry --- 1914
Antonio Ayala --- 1914 - 15 - l6 -17 - 18 - 19 - 20 - 21
Eduardo Castro y Onetti --- 1922
Natalio Chaia --- 1922 - 23 - 24 - 25 - 26 - 30 - 31 - 35 - 36
Tomás Pólito --- 1925
Manuel Veira Pintane --- 1927 - 28
Juan Luciano Martínez --- 1927 - 28 - 29
Carlos Alves y Madrazzo --- 1930 - 32
Juan Satriano --- 1931 - 32 - 35 - 36
Ladislao Gutierrez --- 1933 - 34
Dardo L. Ipar --- 1934
Hipólito Aguirregaray --- 1938 - 39 - 40 - 42 - 43
Miguel Meirelles --- 1941 - 1942
Juan Guruceaga --- 1944 - 45 - 46 - 47- 48 - 49
Gilberto Etchegaray - 1949
Amado Ipar --- 1949 - 1950 - 52 - 53 - 54
Eusebio Dávila ---- 1950 - 51
Carlos A. Becker --- 1951 - 52
Herminio Núñez Louzada -- 1952 - 55 - 56 - 57 - 58 - 59 - 60
Alberto García --- 1953 - 54
Alberto Hiriart --- 1960 - 61 - 62 - 63 - 64 - 65 - 71
Ruben Escajal --- 1971
Donaldo Domínguez --- 1966 - 67 - 69 - 70 - 71
Vicente Tomás Pólito --- 1972 - 73 - 74 - 78 - 79 - 91 - 92
Hugo A. García --- 1974 - 75
Benincasa Cardozo --- 1968 - 69 - 75 - 76
Luis A. Fernández --- 1977 - 1978
José Gil Jubín --- 1979 - 80 - 81
Jorge O. Bianchi --- 1981 - 82
Humberto Lagreca --- 1982 - 83 - 84 - 85 - 86 - 88 - 89 - 90
Nelson Saldaña --- 1986 - 87 -
Angel Generali --- 1987 - 88
Milton Linares --- 1990 - 91
Bertram Becker --- 1993 - 94 - 95
Luis Aguirregaray --- 1996
José María Da Silva --- 1997 - 98
Walter Saúl Bianchi --- 1999 - 2000
Jorge Cardozo --- 2001 - 2002
Nelson Saldanha --- 2003 - 04 - 05 - 06 - 07 - 08
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